המגמה לחקלאות ימית הנה מגמה ייחודית בישראל.

במגמה זו לומדים התלמידים לבגרות 5 יחידות לימוד בתחום הגידול של צמחי מים, דגים, אלמוגים ושרשרת מזון ובהתמקדות על  גידולים למאכל, הפקת חומרים ורבייה וגידול של דגי נוי. כל הגידולים מנותקי מצע ומגודלים על מים בלבד. בכך ישנם אתגרים טכניים רבים. החקלאות היום זה לא מה שחשבתם- היא מעורבת טכנולוגיות מתקדמת ומערכי גידול מורכבים ומגוונים.

תלמידי המגמה לומדים לאורך השנים את אופן הגידול והתחזוקה של דגים, אצות, סרטנים, צמחי תבלין ומרפא, צמחי מאכל, גידול של יצורים תומכים במערך הגידול של המשק החקלאי ורבייה של דגים נוי.

העבודה היא מאוד חווייתית כאשר התלמידים עובדים הרבה בידיים, מקימים מערכות מים בעצמם ומתחזקים מערכות קיימות. התלמידים מחויבים לגדל לפחות שלושה גידולים שונים ובכך נפגשים עם יצורים בעלי רקע גידולי שונה ומאתגר. התלמידים לומדים את ההיבטים האקולוגיים, הממשקיים והמסחריים של גידולי המים.

כחלק מלימודי החקלאות הימית לומדים התלמידים להשיט סירה מהירה (סירת גומי), יוצאים לסיורים במכוני מחקר לגידול צמחי ובעלי חיים ימיים ועורכים סיורים בחמות גידול שונות בארץ ומתנסים בשנירקולים בים להכרת האורגניזמים השונים.

הציון הוא פנימי ומורכב מדוחות סיור ומעבדות ומבחינה עיונית בסיום הלימודים.